Offre de stage M2 en microbiologie

Bactéries sporulées thermophiles hautement thermorésistantes : origine des contaminations alimentairesLes espèces de bactéries sporulées hautement thermorésistantes constituent un problème majeur dans l’industrie des conserves. En effet, bien que non pathogènes, elles sont à l’origine d’instabilités causant des pertes économiques à la filière.Un des problèmes majeurs reste leur détection en petit nombre dans les matières premières : la présence d’une seule spore de ces espèces peut causer l’acidification et ou le gonflement (jusqu’à l’explosion) de la conserve. Les légumes (et ingrédients végétaux) sont souvent incriminés, l’origine de leur contamination étant en partie tellurique. Les conditions actuelles de production pourraient potentiellement causer une augmentation de ces contaminations, mais ceci reste en grande partie méconnu.Le stage portera sur la détection et l’identification de bactéries HRS de différentes origines et par différentes techniques. Le sujet nécessitera la fabrication/stérilisation de conserves modèles. Il fera principalement appel à des méthodes de microbiologie classique, mais également de biologie moléculaire (extraction d’ADN, PCR). La recherche de germes anaérobies stricts permettra au stagiaire d’acquérir la maîtrise du travail en station anaérobie.Il permettra la validation d’une méthode originale de détection de ces contaminants. Ce stage a lieu dans le cadre d’un projet interne à l’Unité Mixte Technologique ACTIA TRANSISPORE regroupant le LUBEM et l’ADRIA Développement. Profil souhaitéBonne connaissance des techniques de microbiologie, biologie moléculaire et intérêt pour l’agroalimentaire. Facilités rédactionnelles. Laboratoire d’accueil :LUBEM – UMT ACTIA TRANSISPORELaboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne EA 38826, Rue de l’université29000 QUIMPER